[cosmetics] Slight improvements in doc
[epclust.git] / epclust / R / computeWerDists.R
index c6fa633..0ad5404 100644 (file)
@@ -3,8 +3,8 @@
 #' Compute the WER distances between the series at specified indices, which are
 #' obtaind by \code{getSeries(indices)}
 #'
-#' @param indices Range of series indices to cluster
-#' @param getSeries Function to retrieve series (argument: 'indices', integer vector),
+#' @param indices Indices of the series to consider
+#' @param getSeries Function to retrieve series (argument: 'inds', integer vector),
 #'   as columns of a matrix
 #' @param ncores Number of cores for parallel runs
 #' @inheritParams claws
@@ -13,7 +13,7 @@
 #'
 #' @export
 computeWerDists <- function(indices, getSeries, nb_series_per_chunk, smooth_lvl=3, nvoice=4,
-       nbytes=4, endian=.Platform$endian, ncores=3, verbose=FALSE, parll=TRUE)
+       nbytes=4, endian=.Platform$endian, ncores=3, verbose=FALSE)
 {
        n <- length(indices)
        L <- length(getSeries(1)) #TODO: not very neat way to get L
@@ -97,6 +97,7 @@ computeWerDists <- function(indices, getSeries, nb_series_per_chunk, smooth_lvl=
        for (inds in indices_cwt)
                computeSaveCWT(inds)
 
+       parll <- (ncores > 1)
        if (parll)
        {
                # outfile=="" to see stderr/stdout on terminal