add TODO Jairo

[epclust.git] / TODO

diff --git a/TODO b/TODO
index 53b4c97..c5f4081 100644 (file)
--- a/TODO
+++ b/TODO
@@ -67,3 +67,38 @@ cwt : trim R part
 // : clever by rows retenir cwt...
 
 Stockage matrices : en colonnes systématiquement ?
+
+TODO: revoir les arguments, simplifier (dans les clustering...),
+  permettre algos de clustering quelconques, args: medoids (curves puis dists), K
+
+Plutôt ça que hack auto notebook generation:
+       https://mail.scipy.org/pipermail/ipython-dev/2014-March/013550.html
+
+#si pas lissage --> on doit trouver 1 : TOCHECK
+#regarder biwavelets smooth.wavelet : c'est comme ça qu'il faut coder
+#Options : smooth_lvl + filtre gaussien (smooth_method ?)
+(this file :
+https://github.com/tgouhier/biwavelet/blob/master/R/smooth.wavelet.R )
+
+=====
+
+Voici le code :
+
+library(epclust)
+
+n <- 5
+N <- 128
+M <- matrix(runif(n * N), nrow = n) #séries en lignes
+M <- t(apply(M, 1, cumsum)) / sqrt(n * N)
+matplot(t(M), type = 'l', lty = 1)
+
+dists3a <- computeWerDists(1:n, function(inds) M[,inds], n)
+
+# je passe de distance Wer à corrélations : moralement tout est à 0
+summary((1 - dists3a[lower.tri(dists3a)]^2) / N / n)
+
+# or, les courbes sont très similaires, nous devrions être proche de 1 !
+corM <- cor(t(M))
+summary(corM[lower.tri(corM)])
+
+---------> à checker