somewhat unroll the code in WER distances computations

[epclust.git] / TODO

diff --git a/TODO b/TODO
index 6937975..7e6aa90 100644 (file)
--- a/TODO
+++ b/TODO
@@ -17,13 +17,22 @@ https://docs.docker.com/engine/getstarted/step_one/
 A faire:
  - finir les experiences (sur nb de classes, nb de curves / chunk, nb de procs)
    et sur d'autres architectures
-        ==> code OK, source("wrapper.R") puis
-        serialize("build", "pathTo2010.csv","pathTo2010.bin")
-        ppam_exe("build",np,"pathTo2010.bin","nbSeriesPerChunk nbClusters 1 2")
-        C = getMedoids("build", "ppamResult.xml", "ppamFinalSeries.bin")
-        quelques_series = deserialize("pathTo2010.bin", rangs...)
-        #plot C ... et quelques_series ...
-        getDistor("buid", "ppamResult.xml", "pathTo2010.bin")
+
+dans old_C_code/build :
+cmake ../stage1/src
+make
+
+dans data/, lancer R puis :
+source("../old_C_code/wrapper.R")
+serialize("../old_C_code/build", "2009.csv","2009.bin",1)
+library(parallel)
+np = detectCores()
+nbSeriesPerChunk = 3000
+nbClusters = 20
+ppam_exe("../old_C_code/build",np,"2009.bin",nbSeriesPerChunk,nbClusters)
+C = getMedoids("../old_C_code/build", "ppamResult.xml", "ppamFinalSeries.bin")
+first100series = deserialize("../old_C_code/build", "2009.bin", "2009.csv.part", "1-100")
+distor = getDistor("../old_C_code/build", "ppamResult.xml", "2009.bin")
 
 - interface matrice -> binaire
         OK
@@ -32,3 +41,10 @@ A faire:
         ??
 
 Piste à explorer pour les comparaisons: H20
+
+renvoyer nombre d'individues par classe ? (+ somme ?)
+hypothèse : données déjà ordonnées 48 1/2H sur 365j
+utiliser du mixmod avec modèles allongés
+doit toutner sur machine plutôt standard, utilisateur "lambda"
+utiliser Rcpp ?
+