[epclust.git] / TODO

simulateur : complètement aléatoire ? from Irish dataset ?
wmtsa : wavBootstrap
wavelets methods in statistics with R - p180

Essayer distance wdist du package biwavelet ?

geometric structure of high dim data and dim reduction 2011

https://docs.docker.com/engine/getstarted/step_one/

A faire:
 - finir les experiences (sur nb de classes, nb de curves / chunk, nb de procs)
   et sur d'autres architectures

Piste à explorer pour les comparaisons: H20

renvoyer nombre d'individues par classe ? (+ somme ?)
hypothèse : données déjà ordonnées 48 1/2H sur 365j
utiliser du mixmod avec modèles allongés
doit tourner sur machine plutôt standard, utilisateur "lambda"
utiliser Rcpp ?

#point avec Jairo:
#rentrer dans code C cwt continue Rwave
#passer partie sowas à C
#fct qui pour deux series (ID, medoides) renvoie distance WER (Rwave ou à moi)
#transformee croisee , smoothing lissage 3 composantes , + calcul pour WER
#determiner nvoice noctave (entre octave + petit et + grand)

#TODO: load some dataset ASCII CSV
#data_bin_file <<- "/tmp/epclust_test.bin"
#unlink(data_bin_file)

#https://stat.ethz.ch/pipermail/r-help/2011-June/280133.html
#randCov = function(d)
#{
#	x <- matrix(rnorm(d*d), nrow=d)
#	x <- x / sqrt(rowSums(x^2))
#	x %*% t(x)
#}

#TODO: soften condition clustering.R line 37 ?
#regarder mapply et mcmapply pour le // (pas OK pour Windows ou GUI... mais ?)
#TODO: map-reduce more appropriate R/clustering.R ligne 88
#Alternative: use bigmemory to share series when CSV or matrix(...)

#' @importFrom synchronicity boost.mutex lock unlock

subtree: epclust, shared. This root folder should remain private

#TODO: use dbs(),
		#https://www.r-bloggers.com/debugging-parallel-code-with-dbs/
		#http://gforge.se/2015/02/how-to-go-parallel-in-r-basics-tips/

synchrones --> somme, pas moyenne

PLOT:
plot manifold 2D distances WER /
fenetre tempo forme des courbes /
medoids /
gain en prevision: clust puis full --> enercast

réduire taille 17519 trop long ?

synchrone : sum
cwt : trim R part
// : clever by rows retenir cwt...

Stockage matrices : en colonnes systématiquement ?

TODO: revoir les arguments, simplifier (dans les clustering...),
  permettre algos de clustering quelconques, args: medoids (curves puis dists), K
Commit	Line	Data
	1	simulateur : complètement aléatoire ? from Irish dataset ?
	2	wmtsa : wavBootstrap
	3	wavelets methods in statistics with R - p180
	4
	5	Essayer distance wdist du package biwavelet ?
	6
	7	geometric structure of high dim data and dim reduction 2011
	8
	9	https://docs.docker.com/engine/getstarted/step_one/
	10
	11	A faire:
	12	- finir les experiences (sur nb de classes, nb de curves / chunk, nb de procs)
	13	et sur d'autres architectures
	14
	15	Piste à explorer pour les comparaisons: H20
	16
	17	renvoyer nombre d'individues par classe ? (+ somme ?)
	18	hypothèse : données déjà ordonnées 48 1/2H sur 365j
	19	utiliser du mixmod avec modèles allongés
	20	doit tourner sur machine plutôt standard, utilisateur "lambda"
	21	utiliser Rcpp ?
	22
	23	#point avec Jairo:
	24	#rentrer dans code C cwt continue Rwave
	25	#passer partie sowas à C
	26	#fct qui pour deux series (ID, medoides) renvoie distance WER (Rwave ou à moi)
	27	#transformee croisee , smoothing lissage 3 composantes , + calcul pour WER
	28	#determiner nvoice noctave (entre octave + petit et + grand)
	29
	30	#TODO: load some dataset ASCII CSV
	31	#data_bin_file <<- "/tmp/epclust_test.bin"
	32	#unlink(data_bin_file)
	33
	34	#https://stat.ethz.ch/pipermail/r-help/2011-June/280133.html
	35	#randCov = function(d)
	36	#{
	37	# x <- matrix(rnorm(d*d), nrow=d)
	38	# x <- x / sqrt(rowSums(x^2))
	39	# x %*% t(x)
	40	#}
	41
	42	#TODO: soften condition clustering.R line 37 ?
	43	#regarder mapply et mcmapply pour le // (pas OK pour Windows ou GUI... mais ?)
	44	#TODO: map-reduce more appropriate R/clustering.R ligne 88
	45	#Alternative: use bigmemory to share series when CSV or matrix(...)
	46
	47	#' @importFrom synchronicity boost.mutex lock unlock
	48
	49	subtree: epclust, shared. This root folder should remain private
	50
	51	#TODO: use dbs(),
	52	#https://www.r-bloggers.com/debugging-parallel-code-with-dbs/
	53	#http://gforge.se/2015/02/how-to-go-parallel-in-r-basics-tips/
	54
	55	synchrones --> somme, pas moyenne
	56
	57	PLOT:
	58	plot manifold 2D distances WER /
	59	fenetre tempo forme des courbes /
	60	medoids /
	61	gain en prevision: clust puis full --> enercast
	62
	63	réduire taille 17519 trop long ?
	64
	65	synchrone : sum
	66	cwt : trim R part
	67	// : clever by rows retenir cwt...
	68
	69	Stockage matrices : en colonnes systématiquement ?
	70
	71	TODO: revoir les arguments, simplifier (dans les clustering...),
	72	permettre algos de clustering quelconques, args: medoids (curves puis dists), K