add git-fat-pull to pre-push hook via initialize.sh

[epclust.git] / TODO

simulateur : complètement aléatoire ? from Irish dataset ?
wavelets methods in statistics with R - p180

00-convertir2009 et 2010.R
01-extractFeatures.R pour 2009 [utilise Stbr.R] (car on prédit 2010, pas besoin)
02-cluster2009.R
03-compute-sum-of-classes2009.R
05-cluster2WER-2009.R
06-prediction.R

Essayer distance wdist du package biwavelet ?

geometric structure of high dim data and dim reduction 2011

https://docs.docker.com/engine/getstarted/step_one/

A faire:
 - finir les experiences (sur nb de classes, nb de curves / chunk, nb de procs)
   et sur d'autres architectures

dans old_C_code/build :
cmake ../stage1/src
make

dans data/, lancer R puis :
source("../old_C_code/wrapper.R")
serialize("../old_C_code/build", "2009.csv","2009.bin",1)
library(parallel)
np = detectCores()
nbSeriesPerChunk = 3000
nbClusters = 20
ppam_exe("../old_C_code/build",np,"2009.bin",nbSeriesPerChunk,nbClusters)
C = getMedoids("../old_C_code/build", "ppamResult.xml", "ppamFinalSeries.bin")
first100series = deserialize("../old_C_code/build", "2009.bin", "2009.csv.part", "1-100")
distor = getDistor("../old_C_code/build", "ppamResult.xml", "2009.bin")

- interface matrice -> binaire
	 OK

 - courbe synchrone
	 ??

Piste à explorer pour les comparaisons: H20

renvoyer nombre d'individues par classe ? (+ somme ?)
hypothèse : données déjà ordonnées 48 1/2H sur 365j
utiliser du mixmod avec modèles allongés
doit toutner sur machine plutôt standard, utilisateur "lambda"
utiliser Rcpp ?