fix generateRunTest for constructionModelesEMGrank; remove man pages (will be roxygen...
[valse.git] / src / test / generate_test_data / helpers / constructionModelesLassoRank.m
diff --git a/src/test/generate_test_data/helpers/constructionModelesLassoRank.m b/src/test/generate_test_data/helpers/constructionModelesLassoRank.m
deleted file mode 100644 (file)
index 6279416..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,40 +0,0 @@
-function[phi,llh] = constructionModelesLassoRank(Pi,Rho,mini,maxi,X,Y,tau,A1,rangmin,rangmax)
-
-       PI = 4.0 * atan(1.0);
-
-       %get matrix sizes
-       [n,p] = size(X);
-       [~,m,k,~] = size(Rho);
-       L = size(A1, 2); %A1 est p x m+1 x L ou p x L ?!
-
-       %On cherche les rangs possiblement intéressants
-       deltaRank = rangmax - rangmin + 1;
-       Size = deltaRank^k;
-       Rank = zeros(Size,k,'int64');
-       for r=1:k
-               %On veut le tableau de toutes les combinaisons de rangs possibles
-               %Dans la première colonne : on répète (rangmax-rangmin)^(k-1) chaque chiffre : ca remplit la colonne
-               %Dans la deuxieme : on répète (rangmax-rangmin)^(k-2) chaque chiffre, et on fait ca (rangmax-rangmin)^2 fois
-               %...
-               %Dans la dernière, on répète chaque chiffre une fois, et on fait ca (rangmin-rangmax)^(k-1) fois.
-               Rank(:,r) = rangmin + reshape(repmat(0:(deltaRank-1), deltaRank^(k-r), deltaRank^(r-1)), Size, 1);
-       end
-
-       %output parameters
-       phi = zeros(p,m,k,L*Size);
-       llh = zeros(L*Size,2);
-       for lambdaIndex=1:L
-               %On ne garde que les colonnes actives
-               %active sera l'ensemble des variables informatives
-               active = A1(:,lambdaIndex);
-               active(active==0) = [];
-               if length(active) > 0
-                       for j=1:Size
-                               [phiLambda,LLF] = EMGrank(Pi(:,lambdaIndex),Rho(:,:,:,lambdaIndex),mini,maxi,X(:,active),Y,tau,Rank(j,:));
-                               llh((lambdaIndex-1)*Size+j,:) = [LLF, sum(Rank(j,:) .* (length(active)-Rank(j,:)+m))];
-                               phi(active,:,:,(lambdaIndex-1)*Size+j) = phiLambda;
-                       end
-               end
-       end
-
-end