fix arrays reading in C, add type Real for double or float

[valse.git] / src / sources / constructionModelesLassoRank.c

diff --git a/src/sources/constructionModelesLassoRank.c b/src/sources/constructionModelesLassoRank.c
index 031e76c..8eee0eb 100644 (file)
--- a/src/sources/constructionModelesLassoRank.c
+++ b/src/sources/constructionModelesLassoRank.c
@@ -7,19 +7,19 @@
 // TODO: comment on constructionModelesLassoRank purpose
 void constructionModelesLassoRank_core(
        // IN parameters
-       const float* Pi,// parametre initial des proportions
-       const float* Rho, // parametre initial de variance renormalisé
+       const Real* Pi,// parametre initial des proportions
+       const Real* Rho, // parametre initial de variance renormalisé
        int mini, // nombre minimal d'itérations dans l'algorithme EM
        int maxi, // nombre maximal d'itérations dans l'algorithme EM
-       const float* X,// régresseurs
-       const float* Y,// réponse
-       float tau, // seuil pour accepter la convergence
+       const Real* X,// régresseurs
+       const Real* Y,// réponse
+       Real tau, // seuil pour accepter la convergence
        const int* A1, // matrice des coefficients des parametres selectionnes
        int rangmin,    //rang minimum autorisé
        int rangmax,    //rang maximum autorisé
        // OUT parameters (all pointers, to be modified)
-       float* phi,// estimateur ainsi calculé par le Lasso
-       float* lvraisemblance,// estimateur ainsi calculé par le Lasso
+       Real* phi,// estimateur ainsi calculé par le Lasso
+       Real* lvraisemblance,// estimateur ainsi calculé par le Lasso
        // additional size parameters
        int n,// taille de l'echantillon
        int p,// nombre de covariables
@@ -73,24 +73,24 @@ for (int r=0; r<k; r++)
                        continue;
 
                //from now on, longueurActive > 0
-               float* phiLambda = (float*)malloc(longueurActive*m*k*sizeof(float));
-               float LLF;
+               Real* phiLambda = (Real*)malloc(longueurActive*m*k*sizeof(Real));
+               Real LLF;
                for (int j=0; j<Size; j++)
                {
                        //[phiLambda,LLF] = EMGrank(Pi(:,lambdaIndex),Rho(:,:,:,lambdaIndex),mini,maxi,X(:,active),Y,tau,Rank(j,:));
                        int* rank = (int*)malloc(k*sizeof(int));
                        for (int r=0; r<k; r++)
                                rank[r] = Rank[mi(j,r,Size,k)];
-                       float* Xactive = (float*)malloc(n*longueurActive*sizeof(float));
+                       Real* Xactive = (Real*)malloc(n*longueurActive*sizeof(Real));
                        for (int i=0; i<n; i++)
                        {
                                for (int jj=0; jj<longueurActive; jj++)
                                        Xactive[mi(i,jj,n,longueurActive)] = X[mi(i,active[jj],n,p)];
                        }
-                       float* PiLambda = (float*)malloc(k*sizeof(float));
+                       Real* PiLambda = (Real*)malloc(k*sizeof(Real));
                        for (int r=0; r<k; r++)
                                PiLambda[r] = Pi[mi(r,lambdaIndex,k,L)];
-                       float* RhoLambda = (float*)malloc(m*m*k*sizeof(float));
+                       Real* RhoLambda = (Real*)malloc(m*m*k*sizeof(Real));
                        for (int u=0; u<m; u++)
                        {
                                for (int v=0; v<m; v++)
@@ -109,7 +109,7 @@ for (int r=0; r<k; r++)
                        //lvraisemblance((lambdaIndex-1)*Size+j,:) = [LLF, dot(Rank(j,:), length(active)-Rank(j,:)+m)];
                        lvraisemblance[mi(lambdaIndex*Size+j,0,L*Size,2)] = LLF;
                        //dot(Rank(j,:), length(active)-Rank(j,:)+m)
-                       float dotProduct = 0.0;
+                       Real dotProduct = 0.0;
                        for (int r=0; r<k; r++)
                                dotProduct += Rank[mi(j,r,Size,k)] * (longueurActive-Rank[mi(j,r,Size,k)]+m);
                        lvraisemblance[mi(lambdaIndex*Size+j,1,Size*L,2)] = dotProduct;