From: Benjamin Auder Date: Tue, 28 Feb 2017 23:57:08 +0000 (+0100) Subject: lighter vertical line on filaments plot X-Git-Url: https://git.auder.net/variants/Cwda/%7B%7B%20asset%28%27mixstore/images/config.php?a=commitdiff_plain;h=6d50a76fc27236cb056a479be395ebe467666c8b;p=talweg.git lighter vertical line on filaments plot --- diff --git a/pkg/R/plot.R b/pkg/R/plot.R index 2e960f5..372abf0 100644 --- a/pkg/R/plot.R +++ b/pkg/R/plot.R @@ -192,7 +192,7 @@ computeFilaments <- function(data, index, limit=60, plot=TRUE) } # Also plot ref curve, in red plot(ref_serie, ylim=yrange, type="l", col="#FF0000", xlab="", ylab="") - abline(v=24, lty=2, col=colors()[56]) + abline(v=24, lty=2, col=colors()[56], lwd=1) } list("index"=index,"neighb_indices"=fdays[sorted_distances$ix[1:nn]],"colors"=colors) diff --git a/reports/report_2017-03-01.13h_average.ipynb b/reports/report_2017-03-01.13h_average.ipynb index b186668..945583a 100644 --- a/reports/report_2017-03-01.13h_average.ipynb +++ b/reports/report_2017-03-01.13h_average.ipynb @@ -19,7 +19,7 @@ }, "outputs": [], "source": [ - "ts_data = read.csv(system.file(\"extdata\",\"pm10_mesures_H_loc.csv\",package=\"talweg\"))\n", + "ts_data = read.csv(system.file(\"extdata\",\"pm10_mesures_H_loc_report.csv\",package=\"talweg\"))\n", "exo_data = read.csv(system.file(\"extdata\",\"meteo_extra_noNAs.csv\",package=\"talweg\"))\n", "data = getData(ts_data, exo_data, input_tz = \"Europe/Paris\", working_tz=\"Europe/Paris\", predict_at=13)" ] @@ -54,7 +54,7 @@ "outputs": [], "source": [ "indices_ch = seq(as.Date(\"2015-01-18\"),as.Date(\"2015-01-24\"),\"days\")\n", - "p_ch_nn = computeForecast(data,indices_ch, \"Neighbors\", \"Neighbors\", simtype=\"mix\")\n", + "p_ch_nn = computeForecast(data, indices_ch, \"Neighbors\", \"Neighbors\", simtype=\"mix\")\n", "p_ch_pz = computeForecast(data, indices_ch, \"Persistence\", \"Zero\", same_day=TRUE)\n", "p_ch_az = computeForecast(data, indices_ch, \"Average\", \"Zero\") #, memory=183)\n", "#p_ch_zz = computeForecast(data, indices_ch, \"Zero\", \"Zero\")" @@ -94,13 +94,6 @@ "#Bleu: prévue, noir: réalisée" ] }, - { - "cell_type": "markdown", - "metadata": {}, - "source": [ - "Prédictions très lisses." - ] - }, { "cell_type": "code", "execution_count": null, @@ -135,22 +128,11 @@ }, "outputs": [], "source": [ - "par(mfrow=c(2,2))\n", - "options(repr.plot.width=9, repr.plot.height=7)\n", - "plotFilamentsBox(data, f3_ch$indices)\n", - "plotFilamentsBox(data, f3_ch$indices+1)\n", - "plotFilamentsBox(data, f4_ch$indices)\n", - "plotFilamentsBox(data, f4_ch$indices+1)\n", + "par(mfrow=c(1,2))\n", + "plotFilamentsBox(data, f3_ch)\n", + "plotFilamentsBox(data, f4_ch)\n", "\n", - "#En haut : jour 3 + lendemain (4) ; en bas : jour 4 + lendemain (5)\n", - "#À gauche : premières 24h ; à droite : 24h suivantes" - ] - }, - { - "cell_type": "markdown", - "metadata": {}, - "source": [ - "Peu de voisins, les courbes sont assez isolées (en particulier les lendemains)." + "#À gauche : jour 3 + lendemain (4) ; à droite : jour 4 + lendemain (5)" ] }, { @@ -162,18 +144,10 @@ "outputs": [], "source": [ "par(mfrow=c(1,2))\n", - "options(repr.plot.width=9, repr.plot.height=4)\n", - "plotRelativeVariability(data, f3_ch$indices)\n", - "plotRelativeVariability(data, f4_ch$indices)\n", + "plotRelVar(data, f3_ch)\n", + "plotRelVar(data, f4_ch)\n", "\n", - "#Variabilité sur 60 courbes au hasard en rouge ; sur nos 60 voisins (+ lendemains) en noir" - ] - }, - { - "cell_type": "markdown", - "metadata": {}, - "source": [ - "Il faudrait que la courbe noire soit nettement plus basse que la courbe rouge." + "#Variabilité globale en rouge ; sur nos 60 voisins (+ lendemains) en noir" ] }, { @@ -191,13 +165,6 @@ "#Non pollué à gauche, pollué à droite" ] }, - { - "cell_type": "markdown", - "metadata": {}, - "source": [ - "Poids plus concentrés autour de 0 pour un jour plus pollué." - ] - }, { "cell_type": "code", "execution_count": null, @@ -251,13 +218,6 @@ "#Noir: neighbors, rouge: persistence, vert: moyenne" ] }, - { - "cell_type": "markdown", - "metadata": {}, - "source": [ - "Neighbors et Average comparables, Persistence moins performante." - ] - }, { "cell_type": "code", "execution_count": null, @@ -274,13 +234,6 @@ "#Bleu: prévue, noir: réalisée" ] }, - { - "cell_type": "markdown", - "metadata": {}, - "source": [ - "À gauche un jour \"bien\" prévu, à droite le pic d'erreur (jour 3)." - ] - }, { "cell_type": "code", "execution_count": null, @@ -294,13 +247,6 @@ "plotPredReal(data, p_ep_az, 3)" ] }, - { - "cell_type": "markdown", - "metadata": {}, - "source": [ - "Average : autre type de prévision." - ] - }, { "cell_type": "code", "execution_count": null, @@ -322,15 +268,11 @@ }, "outputs": [], "source": [ - "par(mfrow=c(2,2))\n", - "options(repr.plot.width=9, repr.plot.height=7)\n", - "plotFilamentsBox(data, f6_ep$indices)\n", - "plotFilamentsBox(data, f6_ep$indices+1)\n", - "plotFilamentsBox(data, f3_ep$indices)\n", - "plotFilamentsBox(data, f3_ep$indices+1)\n", + "par(mfrow=c(1,2))\n", + "plotFilamentsBox(data, f6_ep)\n", + "plotFilamentsBox(data, f3_ep)\n", "\n", - "#En haut : jour 4 + lendemain (5) ; en bas : jour 6 + lendemain (7)\n", - "#À gauche : premières 24h ; à droite : 24h suivantes" + "#À gauche : jour 6 + lendemain (7) ; à droite : jour 3 + lendemain (4)" ] }, { @@ -342,18 +284,10 @@ "outputs": [], "source": [ "par(mfrow=c(1,2))\n", - "options(repr.plot.width=9, repr.plot.height=4)\n", - "plotRelativeVariability(data, f6_ep$indices)\n", - "plotRelativeVariability(data, f3_ep$indices)\n", + "plotRelVar(data, f6_ep)\n", + "plotRelVar(data, f3_ep)\n", "\n", - "#Variabilité sur 60 courbes au hasard en rouge ; sur nos 60 voisins (+ lendemains) en noir" - ] - }, - { - "cell_type": "markdown", - "metadata": {}, - "source": [ - "Il faudrait que la courbe noire soit nettement plus basse que la courbe rouge..." + "#Variabilité globale en rouge ; sur nos 60 voisins (+ lendemains) en noir" ] }, { @@ -369,13 +303,6 @@ "plotSimils(p_ep_nn, 3)" ] }, - { - "cell_type": "markdown", - "metadata": {}, - "source": [ - "Même observation concernant les poids : concentrés près de zéro pour les prédictions avec peu de voisins." - ] - }, { "cell_type": "code", "execution_count": null, @@ -429,13 +356,6 @@ "#Noir: neighbors, rouge: persistence, vert: moyenne" ] }, - { - "cell_type": "markdown", - "metadata": {}, - "source": [ - "Performances des méthodes \"Average\" et \"Neighbors\" identiques ; mauvais résultats pour la persistence." - ] - }, { "cell_type": "code", "execution_count": null, @@ -478,13 +398,6 @@ "f3_np = computeFilaments(data, p_np_nn$getIndexInData(3), plot=TRUE)" ] }, - { - "cell_type": "markdown", - "metadata": {}, - "source": [ - "Jours \"typiques\", donc beaucoup de voisins." - ] - }, { "cell_type": "code", "execution_count": null, @@ -493,15 +406,11 @@ }, "outputs": [], "source": [ - "par(mfrow=c(2,2))\n", - "options(repr.plot.width=9, repr.plot.height=7)\n", - "plotFilamentsBox(data, f5_np$indices)\n", - "plotFilamentsBox(data, f5_np$indices+1)\n", - "plotFilamentsBox(data, f3_np$indices)\n", - "plotFilamentsBox(data, f3_np$indices+1)\n", + "par(mfrow=c(1,2))\n", + "plotFilamentsBox(data, f5_np)\n", + "plotFilamentsBox(data, f3_np)\n", "\n", - "#En haut : jour 3 + lendemain (4) ; en bas : jour 6 + lendemain (7)\n", - "#À gauche : premières 24h ; à droite : 24h suivantes" + "#À gauche : jour 5 + lendemain (6) ; à droite : jour 3 + lendemain (4)" ] }, { @@ -513,18 +422,10 @@ "outputs": [], "source": [ "par(mfrow=c(1,2))\n", - "options(repr.plot.width=9, repr.plot.height=4)\n", - "plotRelativeVariability(data, f5_np$indices)\n", - "plotRelativeVariability(data, f3_np$indices)\n", + "plotRelVar(data, f5_np)\n", + "plotRelVar(data, f3_np)\n", "\n", - "#Variabilité sur 60 courbes au hasard en rouge ; sur nos 60 voisins (+ lendemains) en noir" - ] - }, - { - "cell_type": "markdown", - "metadata": {}, - "source": [ - "Situation meilleure que dans les autres cas, mais assez difficile tout de même." + "#Variabilité globale en rouge ; sur nos 60 voisins (+ lendemains) en noir" ] }, { @@ -540,13 +441,6 @@ "plotSimils(p_np_nn, 3)" ] }, - { - "cell_type": "markdown", - "metadata": {}, - "source": [ - "Répartition des poids difficile à interpréter." - ] - }, { "cell_type": "code", "execution_count": null,