reports/run_time_cl.sh

   1 #!/bin/bash
   2
   3 #$ -N morpheus
   4 #$ -wd /workdir2/auder/morpheus/reports
   5 #$ -m abes
   6 #$ -M benjamin@auder.net
   7 #$ -pe make 50
   8 rm -f .output
   9 #$ -o .output
  10 #$ -j y
  11
  12 module load R
  13
  14 N=1000
  15 nc=50
  16 link="logit"
  17
  18 # arg --vanilla maybe possible on cluster
  19 R --slave --args N=$N nc=$nc link=$link <timings.R >out 2>&1