renaming, refactoring

reorganize folder

set final draft for package

finish simplifications on stage2.R

simplify stage2.R

'update'

add clustering method in biblio

fix stage2.R

avancée sur compréhension de epclust/R/stage2.R

prepared step2.R for first tests (old code, reindented, all in one file)

update code for stage 2 in epclust

'update'

fix comment on initialize.sh

somewhat unroll the code in WER distances computations

add git-fat-pull to pre-push hook via initialize.sh

comment on initialize.sh

fix initialize script (pre-push hook must be executable)

re-add modules as hidden folders

temporarily remove modules

add initialize.sh script to be run after cloning

reorganize .gitignore files

drop potential jupyter usage for R package vignette

add PDF files through git-fat filters

add submodules ppam-mpi and git-fat

use git fat

stop using git-annex

update TODO

remove strange file

add emergency_code

separate TODO and wrapper example

firx error in slave.c

complete wrapper.R; update TODO

clarify main/classif task

major folder reorganisation, R pkg is now epclust/ at first level. Experimental usage of git-annex

TODO: defaults.R + complete parallel launch tasks in main.R

FIX: C code (double, float, ...) + wrapper (read/write data, get medoids)

improve wrapper.R to handle files too

typo: missing 'clister' argument

finalize R 'wrapper' for stage 1; WARNING: changed series encoding. TODO: test

R.pkg: add a TODO

progress on main.R

work on main.R

progress in main.R

progress in main.R

progress on main.R

advance on main.R

progress on main.R

work on draft R package

'update'

'update'

add notes from december 13rd meeting in Lyon

Lecture du code

'update'

add some comments after meeting 17-11-2016

'update'

'update'

add code Jairo

add R wrapper for stage 1

typo

better .gitignore: empty build/ folder

improve project structure

fix CGDS usage, compilation, check usability

rename ppam.sh

Initialize with slightly modified (structure) ppam_mpi