save state; test clustering not OK, all others OK
[epclust.git] / TODO
1 simulateur : complètement aléatoire ? from Irish dataset ?
2 wmtsa : wavBootstrap
3 wavelets methods in statistics with R - p180
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5 Essayer distance wdist du package biwavelet ?
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7 geometric structure of high dim data and dim reduction 2011
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9 https://docs.docker.com/engine/getstarted/step_one/
10
11 A faire:
12 - finir les experiences (sur nb de classes, nb de curves / chunk, nb de procs)
13 et sur d'autres architectures
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15 Piste à explorer pour les comparaisons: H20
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17 renvoyer nombre d'individues par classe ? (+ somme ?)
18 hypothèse : données déjà ordonnées 48 1/2H sur 365j
19 utiliser du mixmod avec modèles allongés
20 doit tourner sur machine plutôt standard, utilisateur "lambda"
21 utiliser Rcpp ?
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23 #point avec Jairo:
24 #rentrer dans code C cwt continue Rwave
25 #passer partie sowas à C
26 #fct qui pour deux series (ID, medoides) renvoie distance WER (Rwave ou à moi)
27 #transformee croisee , smoothing lissage 3 composantes , + calcul pour WER
28 #determiner nvoice noctave (entre octave + petit et + grand)
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30 #TODO: load some dataset ASCII CSV
31 #data_bin_file <<- "/tmp/epclust_test.bin"
32 #unlink(data_bin_file)
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34 #https://stat.ethz.ch/pipermail/r-help/2011-June/280133.html
35 #randCov = function(d)
36 #{
37 # x <- matrix(rnorm(d*d), nrow=d)
38 # x <- x / sqrt(rowSums(x^2))
39 # x %*% t(x)
40 #}
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42 #TODO: soften condition clustering.R line 37 ?
43 #regarder mapply et mcmapply pour le // (pas OK pour Windows ou GUI... mais ?)
44 #TODO: map-reduce more appropriate R/clustering.R ligne 88
45 #Alternative: use bigmemory to share series when CSV or matrix(...)
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47 #' @importFrom synchronicity boost.mutex lock unlock
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49 subtree: epclust, shared. This root folder should remain private
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51 #TODO: use dbs(),
52 #https://www.r-bloggers.com/debugging-parallel-code-with-dbs/
53 #http://gforge.se/2015/02/how-to-go-parallel-in-r-basics-tips/
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55 synchrones --> somme, pas moyenne
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57 PLOT:
58 plot manifold 2D distances WER /
59 fenetre tempo forme des courbes /
60 medoids /
61 gain en prevision: clust puis full --> enercast
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63 réduire taille 17519 trop long ?
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65 synchrone : sum
66 cwt : trim R part
67 // : clever by rows retenir cwt...
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69 Stockage matrices : en colonnes systématiquement ?
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71 TODO: revoir les arguments, simplifier (dans les clustering...),
72 permettre algos de clustering quelconques, args: medoids (curves puis dists), K