WER distances is a regular matrix, fix doc (weird latex error?)

improvements

'update'

'update'

'update'

add some TODOs

parallel version running; TODO: check==sequential, plotting routines, parser; check memory

forgot to pass parll arg

option to run sequentially. various fixes. R CMD check OK

ignore generated binary files while debugging

Fix package, ok for R CMD check - ongoing debug for main function

'update'

add .nbstripout

change submodules

remove .ppam-mpi submodule

Fix unit tests

prepare converter for DB extracts datasets

'update'

preprocessing

de_serialize works. Variables names improved. Code beautified. TODO: clustering tests

throw away old code, prepare tests

complete first draft of package

before computeSynchrones

with parallel::export

export vars to nodes

toward better ID+coeffs management

'update'

'update'

renaming, refactoring

reorganize folder

set final draft for package

finish simplifications on stage2.R

simplify stage2.R

'update'

add clustering method in biblio

fix stage2.R

avancée sur compréhension de epclust/R/stage2.R

prepared step2.R for first tests (old code, reindented, all in one file)

update code for stage 2 in epclust

'update'

fix comment on initialize.sh

somewhat unroll the code in WER distances computations

add git-fat-pull to pre-push hook via initialize.sh

comment on initialize.sh

fix initialize script (pre-push hook must be executable)

re-add modules as hidden folders

temporarily remove modules

add initialize.sh script to be run after cloning

reorganize .gitignore files

drop potential jupyter usage for R package vignette

add PDF files through git-fat filters

add submodules ppam-mpi and git-fat

use git fat

stop using git-annex

update TODO

remove strange file

add emergency_code

separate TODO and wrapper example

firx error in slave.c

complete wrapper.R; update TODO

clarify main/classif task

major folder reorganisation, R pkg is now epclust/ at first level. Experimental usage of git-annex

TODO: defaults.R + complete parallel launch tasks in main.R

FIX: C code (double, float, ...) + wrapper (read/write data, get medoids)

improve wrapper.R to handle files too

typo: missing 'clister' argument

finalize R 'wrapper' for stage 1; WARNING: changed series encoding. TODO: test

R.pkg: add a TODO

progress on main.R

work on main.R

progress in main.R

progress in main.R

progress on main.R

advance on main.R

progress on main.R

work on draft R package

'update'

'update'

add notes from december 13rd meeting in Lyon

Lecture du code

'update'

add some comments after meeting 17-11-2016

'update'

'update'

add code Jairo

add R wrapper for stage 1

typo

better .gitignore: empty build/ folder

improve project structure

fix CGDS usage, compilation, check usability

rename ppam.sh

Initialize with slightly modified (structure) ppam_mpi