X-Git-Url: https://git.auder.net/?p=valse.git;a=blobdiff_plain;f=pkg%2FR%2FconstructionModelesLassoRank.R;h=dc88f676f1ed8ca11e0ec5b91013e304226df309;hp=c219d750d8d207f50e4659be6dad1e4d4cd39fab;hb=e32621012b1660204434a56acc8cf73eac42f477;hpb=2279a641f2bee1db586e7ab1e13726d111d5daaf diff --git a/pkg/R/constructionModelesLassoRank.R b/pkg/R/constructionModelesLassoRank.R deleted file mode 100644 index c219d75..0000000 --- a/pkg/R/constructionModelesLassoRank.R +++ /dev/null @@ -1,61 +0,0 @@ -#' constructionModelesLassoRank -#' -#' TODO: description -#' -#' @param ... -#' -#' @return ... -#' -#' export -constructionModelesLassoRank = function(pi, rho, mini, maxi, X, Y, tau, A1, rangmin, - rangmax, ncores, verbose=FALSE) -{ - #get matrix sizes - n = dim(X)[1] - p = dim(X)[2] - m = dim(rho)[2] - k = dim(rho)[3] - L = dim(A1)[2] - - # On cherche les rangs possiblement intéressants - deltaRank = rangmax - rangmin + 1 - Size = deltaRank^k - Rank = matrix(0, nrow=Size, ncol=k) - for(r in 1:k) - { - # On veut le tableau de toutes les combinaisons de rangs possibles - # Dans la première colonne : on répète (rangmax-rangmin)^(k-1) chaque chiffre : - # ça remplit la colonne - # Dans la deuxieme : on répète (rangmax-rangmin)^(k-2) chaque chiffre, - # et on fait ça (rangmax-rangmin)^2 fois - # ... - # Dans la dernière, on répète chaque chiffre une fois, - # et on fait ça (rangmin-rangmax)^(k-1) fois. - Rank[,r] = rangmin + rep(0:(deltaRank-1), deltaRank^(r-1), each=deltaRank^(k-r)) - } - - # output parameters - phi = array(0, dim=c(p,m,k,L*Size)) - llh = matrix(0, L*Size, 2) #log-likelihood - - # TODO: // loop - for(lambdaIndex in 1:L) - { - # on ne garde que les colonnes actives - # 'active' sera l'ensemble des variables informatives - active = A1[,lambdaIndex] - active = active[-(active==0)] - if (length(active) > 0) - { - for (j in 1:Size) - { - res = EMGrank(Pi[,lambdaIndex], Rho[,,,lambdaIndex], mini, maxi, - X[,active], Y, tau, Rank[j,]) - llh[(lambdaIndex-1)*Size+j,] = - c( res$LLF, sum(Rank[j,] * (length(active)- Rank[j,] + m)) ) - phi[active,,,(lambdaIndex-1)*Size+j] = res$phi - } - } - } - return (list("phi"=phi, "llh" = llh)) -}