X-Git-Url: https://git.auder.net/?p=valse.git;a=blobdiff_plain;f=pkg%2FR%2FconstructionModelesLassoMLE.R;h=3967dfcf623892689d186b6ab7ee8979ddde35ed;hp=50879c935aea7e04042024e2f51a071cb554fa7f;hb=e32621012b1660204434a56acc8cf73eac42f477;hpb=f87ff0f5116c0c1c59c5608e46563ff0f79e5d43 diff --git a/pkg/R/constructionModelesLassoMLE.R b/pkg/R/constructionModelesLassoMLE.R deleted file mode 100644 index 50879c9..0000000 --- a/pkg/R/constructionModelesLassoMLE.R +++ /dev/null @@ -1,37 +0,0 @@ -constructionModelesLassoMLE = function(phiInit,rhoInit,piInit,gamInit,mini,maxi,gamma,glambda, - X,Y,seuil,tau,selected) -{ - #TODO: parameter ncores (chaque tâche peut aussi demander du parallélisme...) - cl = parallel::makeCluster( parallel::detectCores() / 4 ) - parallel::clusterExport(cl=cl, - varlist=c("phiInit","rhoInit","gamInit","mini","maxi","glambda","X","Y","seuil","tau"), - envir=environment()) - #Pour chaque lambda de la grille, on calcule les coefficients - out = parLapply( seq_along(glambda), function(lambdaindex) - { - n = dim(X)[1] - p = dim(phiInit)[1] - m = dim(phiInit)[2] - k = dim(phiInit)[3] - - #TODO: phiInit[selected] et X[selected] sont bien sûr faux; par quoi remplacer ? - #lambda == 0 c'est normal ? -> ED : oui, ici on calcule le maximum de vraisembance, donc on ne pénalise plus - res = EMGLLF(phiInit[selected],rhoInit,piInit,gamInit,mini,maxi,gamma,0.,X[selected],Y,tau) - - #comment évaluer la dimension à partir du résultat et de [not]selected ? - #dimension = ... - - #on veut calculer la vraisemblance avec toutes nos estimations - densite = vector("double",n) - for (r in 1:k) - { - delta = Y%*%rho[,,r] - (X[selected]%*%res$phi[selected,,r]) - densite = densite + pi[r] * - det(rho[,,r])/(sqrt(2*base::pi))^m * exp(-tcrossprod(delta)/2.0) - } - llh = c( sum(log(densite[,lambdaIndex])), (dimension+m+1)*k-1 ) - list("phi"=res$phi, "rho"=res$rho, "pi"=res$pi, "llh" = llh) - }) - parallel::stopCluster(cl) - out -}