X-Git-Url: https://git.auder.net/?p=valse.git;a=blobdiff_plain;f=pkg%2FR%2FEMGLLF.R;h=5484706995a58541c2a95c237ad8cb4d6d1a1eb9;hp=2b1a0af45cdbb5d573858862e61e7533d035871f;hb=567a7c388285ef17ce1e49d295527937dbfadf66;hpb=4fed76cce5e3347a8f82457603d77bf38a02b619

diff --git a/pkg/R/EMGLLF.R b/pkg/R/EMGLLF.R
index 2b1a0af..5484706 100644
--- a/pkg/R/EMGLLF.R
+++ b/pkg/R/EMGLLF.R
@@ -2,17 +2,40 @@
 #'
 #' Description de EMGLLF
 #'
-#' @param phiInit ...
+#' @param phiInit Parametre initial de moyenne renormalisé
+#' @param rhoInit Parametre initial de variance renormalisé
+#' @param piInit Parametre initial des proportions
+#' @param gamInit Paramètre initial des probabilités a posteriori de chaque échantillon
+#' @param mini Nombre minimal d'itérations dans l'algorithme EM
+#' @param maxi Nombre maximal d'itérations dans l'algorithme EM
+#' @param gamma Puissance des proportions dans la pénalisation pour un Lasso adaptatif
+#' @param lambda Valeur du paramètre de régularisation du Lasso
+#' @param X Régresseurs
+#' @param Y Réponse
+#' @param tau Seuil pour accepter la convergence
 #'
-#' @return ...
+#' @return A list ... phi,rho,pi,LLF,S,affec:
+#'   phi : parametre de moyenne renormalisé, calculé par l'EM
+#'   rho : parametre de variance renormalisé, calculé par l'EM
+#'   pi : parametre des proportions renormalisé, calculé par l'EM
+#'   LLF : log vraisemblance associée à cet échantillon, pour les valeurs estimées des paramètres
+#'   S : ... affec : ...
 #'
-#' @examples
-#' ...
-#' ...
 #' @export
 EMGLLF <- function(phiInit, rhoInit, piInit, gamInit,
 	mini, maxi, gamma, lambda, X, Y, tau)
 {
-	.Call("EMGLLF", phiInit, rhoInit, piInit, gamInit,
-		mini, maxi, gamma, lambda, X, Y, tau, PACKAGE="valse")
+	#TEMPORARY: use R version
+	return (EMGLLF_R(phiInit, rhoInit, piInit, gamInit,mini, maxi, gamma, lambda, X, Y, tau))
+
+	n = nrow(X) #nombre d'echantillons
+	p = ncol(X) #nombre de covariables
+	m = ncol(Y) #taille de Y (multivarié)
+	k = length(piInit) #nombre de composantes dans le mélange
+	.Call("EMGLLF",
+		phiInit, rhoInit, piInit, gamInit, mini, maxi, gamma, lambda, X, Y, tau,
+		phi=double(p*m*k), rho=double(m*m*k), pi=double(k), LLF=double(maxi),
+			S=double(p*m*k), affec=integer(n),
+		n, p, m, k,
+		PACKAGE="valse")
 }