constructionModelesLassoMLE = function(phiInit,rhoInit,piInit,gamInit,mini,maxi,gamma, X,Y,seuil,tau,selected, parallel = FALSE) { if (parallel) { #TODO: parameter ncores (chaque tâche peut aussi demander du parallélisme...) cl = parallel::makeCluster( parallel::detectCores() / 4 ) parallel::clusterExport(cl=cl, varlist=c("phiInit","rhoInit","gamInit","mini","maxi","X","Y","seuil","tau"), envir=environment()) #Pour chaque lambda de la grille, on calcule les coefficients out = parLapply( seq_along(glambda), function(lambda) { n = dim(X)[1] p = dim(phiInit)[1] m = dim(phiInit)[2] k = dim(phiInit)[3] #TODO: phiInit[selected] et X[selected] sont bien sûr faux; par quoi remplacer ? #lambda == 0 c'est normal ? -> ED : oui, ici on calcule le maximum de vraisembance, donc on ne pénalise plus res = EMGLLF(phiInit[selected],rhoInit,piInit,gamInit,mini,maxi,gamma,0.,X[selected],Y,tau) #comment évaluer la dimension à partir du résultat et de [not]selected ? #dimension = ... #on veut calculer la vraisemblance avec toutes nos estimations densite = vector("double",n) for (r in 1:k) { delta = Y%*%rho[,,r] - (X[selected]%*%res$phi[selected,,r]) densite = densite + pi[r] * det(rho[,,r])/(sqrt(2*base::pi))^m * exp(-tcrossprod(delta)/2.0) } llh = c( sum(log(densite[,lambda])), (dimension+m+1)*k-1 ) list("phi"=res$phi, "rho"=res$rho, "pi"=res$pi, "llh" = llh) }) parallel::stopCluster(cl) out } else { #Pour chaque lambda de la grille, on calcule les coefficients n = dim(X)[1] p = dim(phiInit)[1] m = dim(phiInit)[2] k = dim(phiInit)[3] L = length(selected) phi = list() phiLambda = array(0, dim = c(p,m,k)) rho = list() pi = list() llh = list() for (lambda in 1:L){ sel.lambda = selected[[lambda]] col.sel = which(colSums(sel.lambda)!=0) res_EM = EMGLLF(phiInit[col.sel,,],rhoInit,piInit,gamInit,mini,maxi,gamma,0.,X[,col.sel],Y,tau) phiLambda2 = res_EM$phi rhoLambda = res_EM$rho piLambda = res_EM$pi for (j in 1:length(col.sel)){ phiLambda[col.sel[j],,] = phiLambda2[j,,] } dimension = 0 for (j in 1:p){ b = setdiff(1:m, sel.lambda[,j]) if (length(b) > 0){ phiLambda[j,b,] = 0.0 } dimension = dimension + sum(sel.lambda[,j]!=0) } #on veut calculer la vraisemblance avec toutes nos estimations densite = vector("double",n) for (r in 1:k) { delta = Y%*%rhoLambda[,,r] - (X[, col.sel]%*%phiLambda[col.sel,,r]) densite = densite + piLambda[r] * det(rhoLambda[,,r])/(sqrt(2*base::pi))^m * exp(-tcrossprod(delta)/2.0) } llhLambda = c( sum(log(densite)), (dimension+m+1)*k-1 ) rho[[lambda]] = rhoLambda phi[[lambda]] = phiLambda pi[[lambda]] = piLambda llh[[lambda]] = llhLambda } } return(list("phi"=phi, "rho"=rho, "pi"=pi, "llh" = llh)) }