X-Git-Url: https://git.auder.net/?a=blobdiff_plain;f=src%2Fsources%2FconstructionModelesLassoRank.c;fp=src%2Fsources%2FconstructionModelesLassoRank.c;h=0000000000000000000000000000000000000000;hb=7f1a6cf08a4d4d67e8a95b8c1c0cc74ff3deb5a4;hp=11153118fd17e21da24bbee13f4731b0fff2e805;hpb=31ef8a5c9bbaefcf40d2c2bad43b27d469c28c34;p=valse.git

diff --git a/src/sources/constructionModelesLassoRank.c b/src/sources/constructionModelesLassoRank.c
deleted file mode 100644
index 1115311..0000000
--- a/src/sources/constructionModelesLassoRank.c
+++ /dev/null
@@ -1,138 +0,0 @@
-#include <stdlib.h>
-#include <omp.h>
-#include <gsl/gsl_linalg.h>
-#include "EMGrank.h"
-#include "utils.h"
-
-// TODO: comment on constructionModelesLassoRank purpose
-void constructionModelesLassoRank_core(
-	// IN parameters
-	const Real* pi,// parametre initial des proportions
-	const Real* rho, // parametre initial de variance renormalisé
-	int mini, // nombre minimal d'itérations dans l'algorithme EM
-	int maxi, // nombre maximal d'itérations dans l'algorithme EM
-	const Real* X,// régresseurs
-	const Real* Y,// réponse
-	Real tau, // seuil pour accepter la convergence
-	const int* A1, // matrice des coefficients des parametres selectionnes
-	int rangmin,	//rang minimum autorisé
-	int rangmax,	//rang maximum autorisé
-	// OUT parameters (all pointers, to be modified)
-	Real* phi,// estimateur ainsi calculé par le Lasso
-	Real* llh,// estimateur ainsi calculé par le Lasso
-	// additional size parameters
-	int n,// taille de l'echantillon
-	int p,// nombre de covariables
-	int m,// taille de Y (multivarié)
-	int k,// nombre de composantes
-	int L)// taille de glambda
-{
-	//On cherche les rangs possiblement intéressants
-	int deltaRank = rangmax-rangmin+1;
-	int Size = (int)pow(deltaRank,k);
-	int* Rank = (int*)malloc(Size*k*sizeof(int));
-	for (int r=0; r<k; r++)
-	{
-		// On veut le tableau de toutes les combinaisons de rangs possibles
-		// Dans la première colonne : on répète (rangmax-rangmin)^(k-1) chaque chiffre :
-		//   ça remplit la colonne
-		// Dans la deuxieme : on répète (rangmax-rangmin)^(k-2) chaque chiffre,
-		//   et on fait ça (rangmax-rangmin)^2 fois
-		// ...
-		// Dans la dernière, on répète chaque chiffre une fois,
-		//   et on fait ça (rangmin-rangmax)^(k-1) fois.
-		int indexInRank = 0;
-		int value = 0;
-		while (indexInRank < Size)
-		{
-			int upperBoundU = (int)pow(deltaRank,k-r-1);
-			for (int u=0; u<upperBoundU; u++)
-				Rank[mi(indexInRank++,r,Size,k)] = rangmin + value;
-			value = (value+1) % deltaRank;
-		}
-	}
-
-	//Initialize phi to zero, because unactive variables won't be assigned
-	for (int i=0; i<p*m*k*L*Size; i++)
-		phi[i] = 0.0;
-	for (int i=0; i<L*Size*2; i++)
-		llh[i] = INFINITY;
-
-	//initiate parallel section
-	int lambdaIndex;
-	omp_set_num_threads(OMP_NUM_THREADS);
-	#pragma omp parallel default(shared) private(lambdaIndex)
-	{
-	#pragma omp for schedule(dynamic,CHUNK_SIZE) nowait
-	for (lambdaIndex=0; lambdaIndex<L; lambdaIndex++)
-	{
-		//On ne garde que les colonnes actives : active sera l'ensemble des variables informatives
-		int* active = (int*)malloc(p*sizeof(int));
-		int longueurActive = 0;
-		for (int j=0; j<p; j++)
-		{
-			if (A1[mi(j,lambdaIndex,p,L)] != 0)
-				active[longueurActive++] = A1[mi(j,lambdaIndex,p,L)] - 1;
-		}
-		if (longueurActive == 0)
-			continue;
-
-		//from now on, longueurActive > 0
-		Real* phiLambda = (Real*)malloc(longueurActive*m*k*sizeof(Real));
-		Real LLF;
-		for (int j=0; j<Size; j++)
-		{
-			int* rank = (int*)malloc(k*sizeof(int));
-			for (int r=0; r<k; r++)
-				rank[r] = Rank[mi(j,r,Size,k)];
-			Real* Xactive = (Real*)malloc(n*longueurActive*sizeof(Real));
-			for (int i=0; i<n; i++)
-			{
-				for (int jj=0; jj<longueurActive; jj++)
-					Xactive[mi(i,jj,n,longueurActive)] = X[mi(i,active[jj],n,p)];
-			}
-			Real* piLambda = (Real*)malloc(k*sizeof(Real));
-			for (int r=0; r<k; r++)
-				piLambda[r] = pi[mi(r,lambdaIndex,k,L)];
-			Real* rhoLambda = (Real*)malloc(m*m*k*sizeof(Real));
-			for (int u=0; u<m; u++)
-			{
-				for (int v=0; v<m; v++)
-				{
-					for (int r=0; r<k; r++)
-						rhoLambda[ai(u,v,r,m,m,k)] = rho[ai4(u,v,r,lambdaIndex,m,m,k,L)];
-				}
-			}
-			EMGrank_core(piLambda,rhoLambda,mini,maxi,Xactive,Y,tau,rank,
-				phiLambda,&LLF,
-				n,longueurActive,m,k);
-			free(rank);
-			free(Xactive);
-			free(piLambda);
-			free(rhoLambda);
-			//llh[(lambdaIndex-1)*Size+j,] = c(LLF, ...)
-			llh[mi(lambdaIndex*Size+j,0,L*Size,2)] = LLF;
-			//sum(Rank[j,] * (length(active)- Rank[j,] + m)) )
-			Real dotProduct = 0.0;
-			for (int r=0; r<k; r++)
-				dotProduct += Rank[mi(j,r,Size,k)] * (longueurActive-Rank[mi(j,r,Size,k)]+m);
-			llh[mi(lambdaIndex*Size+j,1,Size*L,2)] = dotProduct;
-			//phi[active,,,(lambdaIndex-1)*Size+j] = res$phi
-			for (int jj=0; jj<longueurActive; jj++)
-			{
-				for (int mm=0; mm<m; mm++)
-				{
-					for (int r=0; r<k; r++)
-					{
-						phi[ai4(active[jj],mm,r,lambdaIndex*Size+j,p,m,k,L*Size)] =
-							phiLambda[ai(jj,mm,r,longueurActive,m,k)];
-					}
-				}
-			}
-		}
-		free(active);
-		free(phiLambda);
-	}
-	}
-	free(Rank);
-}