X-Git-Url: https://git.auder.net/?a=blobdiff_plain;f=pkg%2FR%2FEMGLLF.R;h=7d9ee776ccce08d21a4e65e870d0d435ea5b5237;hb=086ca318ed5580e961ceda3f1e122a2da58e4427;hp=e600032079b475bba29c227093c4d28228db3a34;hpb=f33f35efc9a01f93bb61959522d90ee6a76b892e;p=valse.git

diff --git a/pkg/R/EMGLLF.R b/pkg/R/EMGLLF.R
index e600032..7d9ee77 100644
--- a/pkg/R/EMGLLF.R
+++ b/pkg/R/EMGLLF.R
@@ -1 +1,38 @@
-#TODO: wrapper on C function
+#' EMGLLF
+#'
+#' Description de EMGLLF
+#'
+#' @param phiInit Parametre initial de moyenne renormalisé
+#' @param rhoInit Parametre initial de variance renormalisé
+#' @param piInit Parametre initial des proportions
+#' @param gamInit Paramètre initial des probabilités a posteriori de chaque échantillon
+#' @param mini Nombre minimal d'itérations dans l'algorithme EM
+#' @param maxi Nombre maximal d'itérations dans l'algorithme EM
+#' @param gamma Puissance des proportions dans la pénalisation pour un Lasso adaptatif
+#' @param lambda Valeur du paramètre de régularisation du Lasso
+#' @param X Régresseurs
+#' @param Y Réponse
+#' @param tau Seuil pour accepter la convergence
+#'
+#' @return A list ... phi,rho,pi,LLF,S,affec:
+#'   phi : parametre de moyenne renormalisé, calculé par l'EM
+#'   rho : parametre de variance renormalisé, calculé par l'EM
+#'   pi : parametre des proportions renormalisé, calculé par l'EM
+#'   LLF : log vraisemblance associée à cet échantillon, pour les valeurs estimées des paramètres
+#'   S : ... affec : ...
+#'
+#' @export
+EMGLLF <- function(phiInit, rhoInit, piInit, gamInit,
+	mini, maxi, gamma, lambda, X, Y, tau)
+{
+	n = nrow(X) #nombre d'echantillons
+	p = ncol(X) #nombre de covariables
+	m = ncol(Y) #taille de Y (multivarié)
+	k = length(piInit) #nombre de composantes dans le mélange
+	.Call("EMGLLF",
+		phiInit, rhoInit, piInit, gamInit, mini, maxi, gamma, lambda, X, Y, tau,
+		phi=double(p*m*k), rho=double(m*m*k), pi=double(k), LLF=double(maxi),
+			S=double(p*m*k), affec=integer(n),
+		n, p, m, k,
+		PACKAGE="valse")
+}