X-Git-Url: https://git.auder.net/?a=blobdiff_plain;f=pkg%2FR%2FEMGLLF.R;h=0d8607cb7d31273fe4befea28492e340925ef6fa;hb=23b9fb13bc6e82d7ca43bfb83aa85b6cd69c52c0;hp=bf4476b63d839fc1f260ff7b005309f32e80d4af;hpb=228ee602a972fcac6177db0d539bf9d0c5fa477f;p=valse.git

diff --git a/pkg/R/EMGLLF.R b/pkg/R/EMGLLF.R
index bf4476b..0d8607c 100644
--- a/pkg/R/EMGLLF.R
+++ b/pkg/R/EMGLLF.R
@@ -19,7 +19,8 @@
 #'   rho : parametre de variance renormalisé, calculé par l'EM
 #'   pi : parametre des proportions renormalisé, calculé par l'EM
 #'   LLF : log vraisemblance associée à cet échantillon, pour les valeurs estimées des paramètres
-#'   S : ... affec : ...
+#'   S : ...
+#'   affec : ...
 #'
 #' @export
 EMGLLF <- function(phiInit, rhoInit, piInit, gamInit, mini, maxi, gamma, lambda, 
@@ -41,6 +42,7 @@ EMGLLF <- function(phiInit, rhoInit, piInit, gamInit, mini, maxi, gamma, lambda,
     X, Y, eps, phi = double(p * m * k), rho = double(m * m * k), pi = double(k), 
     LLF = double(maxi), S = double(p * m * k), affec = integer(n), n, p, m, k, 
     PACKAGE = "valse")
+	list(phi = phi, rho = rho, pi = pi, llh = llh, S = S, affec=affec)
 }
 
 # R version - slow but easy to read
@@ -72,7 +74,6 @@ EMGLLF <- function(phiInit, rhoInit, piInit, gamInit, mini, maxi, gamma, lambda,
   ps2 <- array(0, dim = c(p, m, k))
   X2 <- array(0, dim = c(n, p, k))
   Y2 <- array(0, dim = c(n, m, k))
-  EPS <- 1e-15
 
   for (ite in 1:maxi)
   {
@@ -190,5 +191,6 @@ EMGLLF <- function(phiInit, rhoInit, piInit, gamInit, mini, maxi, gamma, lambda,
       break
   }
 
-  list(phi = phi, rho = rho, pi = pi, llh = llh, S = S)
+	affec = apply(gam, 1, which.max)
+  list(phi = phi, rho = rho, pi = pi, llh = llh, S = S, affec=affec)
 }