X-Git-Url: https://git.auder.net/?a=blobdiff_plain;f=TODO;h=7e6aa9092b61a38905205d83d05674121f1ff160;hb=c3fcb4f1851cc449b4a834ad601e1d3db8fa4265;hp=69379751e75b51a85d125319a34104f062fa668d;hpb=5edda192f1a634ba284acdea7b6302f60df7b000;p=epclust.git diff --git a/TODO b/TODO index 6937975..7e6aa90 100644 --- a/TODO +++ b/TODO @@ -17,13 +17,22 @@ https://docs.docker.com/engine/getstarted/step_one/ A faire: - finir les experiences (sur nb de classes, nb de curves / chunk, nb de procs) et sur d'autres architectures - ==> code OK, source("wrapper.R") puis - serialize("build", "pathTo2010.csv","pathTo2010.bin") - ppam_exe("build",np,"pathTo2010.bin","nbSeriesPerChunk nbClusters 1 2") - C = getMedoids("build", "ppamResult.xml", "ppamFinalSeries.bin") - quelques_series = deserialize("pathTo2010.bin", rangs...) - #plot C ... et quelques_series ... - getDistor("buid", "ppamResult.xml", "pathTo2010.bin") + +dans old_C_code/build : +cmake ../stage1/src +make + +dans data/, lancer R puis : +source("../old_C_code/wrapper.R") +serialize("../old_C_code/build", "2009.csv","2009.bin",1) +library(parallel) +np = detectCores() +nbSeriesPerChunk = 3000 +nbClusters = 20 +ppam_exe("../old_C_code/build",np,"2009.bin",nbSeriesPerChunk,nbClusters) +C = getMedoids("../old_C_code/build", "ppamResult.xml", "ppamFinalSeries.bin") +first100series = deserialize("../old_C_code/build", "2009.bin", "2009.csv.part", "1-100") +distor = getDistor("../old_C_code/build", "ppamResult.xml", "2009.bin") - interface matrice -> binaire OK @@ -32,3 +41,10 @@ A faire: ?? Piste à explorer pour les comparaisons: H20 + +renvoyer nombre d'individues par classe ? (+ somme ?) +hypothèse : données déjà ordonnées 48 1/2H sur 365j +utiliser du mixmod avec modèles allongés +doit toutner sur machine plutôt standard, utilisateur "lambda" +utiliser Rcpp ? +