X-Git-Url: https://git.auder.net/?a=blobdiff_plain;f=TODO;h=7e6aa9092b61a38905205d83d05674121f1ff160;hb=47395e4f93feadfb1b8f6ab11742a4616b32c1d5;hp=e4f87b5288da6418519ad999fb1de5b6c5f2681c;hpb=1568db29d0034a2b7363d288a7641d738fc0c57e;p=epclust.git diff --git a/TODO b/TODO index e4f87b5..7e6aa90 100644 --- a/TODO +++ b/TODO @@ -13,3 +13,38 @@ Essayer distance wdist du package biwavelet ? geometric structure of high dim data and dim reduction 2011 https://docs.docker.com/engine/getstarted/step_one/ + +A faire: + - finir les experiences (sur nb de classes, nb de curves / chunk, nb de procs) + et sur d'autres architectures + +dans old_C_code/build : +cmake ../stage1/src +make + +dans data/, lancer R puis : +source("../old_C_code/wrapper.R") +serialize("../old_C_code/build", "2009.csv","2009.bin",1) +library(parallel) +np = detectCores() +nbSeriesPerChunk = 3000 +nbClusters = 20 +ppam_exe("../old_C_code/build",np,"2009.bin",nbSeriesPerChunk,nbClusters) +C = getMedoids("../old_C_code/build", "ppamResult.xml", "ppamFinalSeries.bin") +first100series = deserialize("../old_C_code/build", "2009.bin", "2009.csv.part", "1-100") +distor = getDistor("../old_C_code/build", "ppamResult.xml", "2009.bin") + +- interface matrice -> binaire + OK + + - courbe synchrone + ?? + +Piste à explorer pour les comparaisons: H20 + +renvoyer nombre d'individues par classe ? (+ somme ?) +hypothèse : données déjà ordonnées 48 1/2H sur 365j +utiliser du mixmod avec modèles allongés +doit toutner sur machine plutôt standard, utilisateur "lambda" +utiliser Rcpp ? +